不会,正常人体大肠内应该是85%的有益菌,15%的有害菌,而现代人大肠里的有害菌高达30%.大肠水疗是用水清洗大肠,而不是消毒和灭菌,所以只能减少细菌的量,而不会改变细菌种群,并且,在清洁的环境里,更有利于有益菌生长,使大肠细菌种群更趋于平衡,对人体产生积极作用,去除疾病隐患.
　　 梅米研究所做过一个试验,这个试验表明即使用正常的灭菌剂也不能对大肠进行有效地消毒.他们将肠圈结扎好,放入70%乙醚;25%甲酚混合液;5%硝酸银溶液;氯化锌的饱和溶液;5%酚;10%鹿香草酚的酒溶液.在以上情况下灭菌都失败了,那么对于肠道水疗法中所用的水,又如何将全部有害菌清除呢?细菌是存在于小肠与大肠所有地方的.在健康的结肠中,细菌的成是85%有益的乳酸杆菌和15%有害的大肠杆菌,由于我们依靠现代化食物生存,大多数人的细菌组成都是倒过来的.因此大多数人的结肠中,没有足够的有益菌群.而肠道水疗法可以使肠道清污.为有益菌提供一个良好的繁殖环境.故肠道水疗法不会使人体肠道中的菌群失调.